差異雜交(differential hybridization)是將基因組文庫的重組噬菌體DNA轉(zhuǎn)移至硝酸纖維素膜上,用兩種混合的不同cDNA探針(如:轉(zhuǎn)移性和非轉(zhuǎn)移性癌組織的mRNA逆轉(zhuǎn)錄后的cDNA)分別與濾膜上的DNA雜交,分析兩張濾膜上對應(yīng)位置雜交信息以分離差異表達(dá)的基因。適用于基因組不太復(fù)雜的真核生物(如酵母)表達(dá)基因的比較,假陽性率較低。但對基因組非常復(fù)雜的鹽酸核生物,則因工作量太大,表達(dá)的序列所占百分比較低(僅5%左右),價(jià)值不大。