基因表達系列分析（SAGE）是通過快速和詳細分析成千上萬個EST（express sequenced tags）來尋找出表達豐富度不同的SAGE標簽序列。再次訪法中，通過限制性酶切可以產生非常短的cDNA（10-14bp）標簽，并通過PCR擴增和連接，隨后對連接題進行測序。SAGE大大簡化和加快了3’端表達序列標簽的收集和測序。同DD一樣，SAGE是一個“開放”的系統(tǒng)，可以發(fā)現(xiàn)新的未知的序列。在進行標本的比較之前，SAGE在cDNA的產生和處理上需要較多個步驟。由于SAGE是一個依賴DNA測序的基因計量方法，它對基因表達的測定比DD更加量化。由于需要進行大量的測序反應，所以費用因素使大多數研究機構對其廣泛應用的主要限制。