害蟲種類復(fù)雜，單食性和寡食性害蟲相對(duì)較多藥用植物有上千種，包括草本、藤本、木本等各類植物，生長(zhǎng)年齡有一年生、幾年生甚至幾十年生。因此，中藥材的害蟲種類相當(dāng)復(fù)雜、繁多。由于各種藥用植物含有復(fù)雜的化學(xué)成分，決定了有某些特殊害蟲喜食這些植物或趨向于這些植物上產(chǎn)卵。因此，藥用植物上單食性和寡食性害蟲相對(duì)較多，如枸杞
實(shí)蠅、山茱萸蛀果蛾等。它們只食害一種或幾種近緣藥用植物。
  道地藥材和病蟲害的關(guān)系我國(guó)藥用植物栽培有歷史形成的主產(chǎn)區(qū)，也有引種栽培的新植區(qū)，在主產(chǎn)區(qū)栽培的藥材稱為道地藥材。由于地方昆蟲區(qū)系決定了道地藥材的害蟲種類，又因主產(chǎn)區(qū)相對(duì)種植面積較大、長(zhǎng)期栽培，病源蟲源積累較多，致使某些病蟲害發(fā)生嚴(yán)重。如地黃主產(chǎn)河南，當(dāng)?shù)厥敲藁óa(chǎn)區(qū)，因此棉紅蜘蛛為害十分嚴(yán)重；其他新植區(qū)面積較小，棉紅蜘蛛為害較輕。北沙參鉆心蟲在山東發(fā)生嚴(yán)重，引種到河北等地，均未發(fā)現(xiàn)此蟲為害。
  藥用植物鉆蛀性害蟲和地下病蟲害為害嚴(yán)重藥用植物鉆蛀性害蟲和地下害蟲種類多、為害嚴(yán)重，尤其是常常為害藥用部位（花、果、根、莖等），造成對(duì)產(chǎn)量的直接威脅。許多重要藥用植物的根、塊根和鱗莖等地下部分，既是藥用植物營(yíng)養(yǎng)成分積累的部位，又是藥用部位。這些地下部分極易遭受土壤中的病原菌及害蟲的為害，導(dǎo)致藥材品質(zhì)下降甚至死亡。由于地下部分病害發(fā)病原因復(fù)雜，防治十分困難，因而損失慘重，歷來(lái)是植物病害中的難點(diǎn)，而這一問題在藥用植物中尤其突出。幾乎所有的以地下部分入藥的藥用植物都存在嚴(yán)重的地下部分病害，其中以真菌病害為主，也有細(xì)菌和線蟲病害。在生產(chǎn)上較為突出的例子如人參銹腐病和根腐病、貝母腐爛病、白術(shù)根腐病、附子白絹病、當(dāng)歸根腐病等。
  無(wú)性繁殖材料是病害初侵染的重要來(lái)源許多重要的藥用植物采用無(wú)性繁殖，如地黃、貝母、元胡等。有些是種子育苗后用種苗擴(kuò)大種植，如人參、當(dāng)歸等。這些種苗不僅用于主產(chǎn)區(qū)，還常被引種到新產(chǎn)區(qū)。由于這些繁殖材料基本都是藥用植物的根、塊根、鱗莖等地下部分，本身常常受到嚴(yán)重的病害侵染，所以它們是病害的重要侵染來(lái)源。如牡丹分根栽植時(shí)，不剔除帶有根結(jié)線蟲的根段，致使根結(jié)線蟲病發(fā)生嚴(yán)重。