一是感病嚴(yán)重的棉籽，枯、黃萎病是制約棉花產(chǎn)量的頑癥之一，棉籽又是病菌的載體。病菌可以隨著棉籽迅速傳播。因此，枯、黃萎病嚴(yán)重地區(qū)的棉種，不能調(diào)入感病輕的棉區(qū)，更不能調(diào)入無(wú)病棉區(qū)。

二是伏前桃和晚秋桃棉籽。伏前桃和晚秋桃生長(zhǎng)發(fā)育不良，成熟度差，鈴重輕，種子發(fā)芽率低，長(zhǎng)勢(shì)脆弱。

三是剝桃花的棉籽，有些棉農(nóng)對(duì)發(fā)育較為充分的伏桃，仍然有搶墑剝桃花的陋習(xí)。凡剝桃花的棉籽，由于沒有充分成熟，更沒有完成后熟作用，絕對(duì)不能推向市場(chǎng)。

四是噴施了乙烯利的棉籽。噴施乙烯利雖可促棉花早熟3-4天，但對(duì)棉籽損傷較大，致使發(fā)育不全，不能做種。

五是退化嚴(yán)重的品種。棉花是異交作物，異交率在8%左右，有些棉農(nóng)多年沒有更換新的品種，棉種純度只有70-80%，品質(zhì)退化嚴(yán)重，繼續(xù)使用必將導(dǎo)致減產(chǎn)，品質(zhì)下降。

六與農(nóng)藥、化肥一起存放的棉籽。有些農(nóng)戶將棉籽與農(nóng)藥、化肥長(zhǎng)期存放于一個(gè)倉(cāng)庫(kù)且通氣不良，由于農(nóng)藥、化肥散發(fā)的有毒氣體損傷棉籽正常的生理，造成發(fā)芽率銳減。

七是儲(chǔ)存年代過久的棉籽。棉種存放半年一般發(fā)芽率在80%以上，在無(wú)低溫冷藏設(shè)備的情況下，棉種的壽命與儲(chǔ)存年代呈負(fù)面增長(zhǎng)。

　　八是水泥曬場(chǎng)上曬過的棉籽。在水泥曬場(chǎng)上曬含水量較高的棉籽，由于呼吸強(qiáng)度旺盛，造成棉種生理機(jī)能失調(diào)，部分棉籽形成啞籽，失去發(fā)芽能力。

　　九是機(jī)械損傷過重的棉籽。精加工的包衣棉種中，機(jī)械損傷率應(yīng)控制在2%以內(nèi)。破籽率超過2%以上的棉籽，受藥物浸染過重，對(duì)發(fā)芽率影響很大，破籽率過高就不宜于作種用。