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資金預算
資金投入和軟件功能及服務情況基本呈正比，只有明確資金狀況的情況下才能更清醒的限定系統(tǒng)功能，否則很有可能導致竹籃打水一場空。
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明確實施LIMS的目的
明確實施LIMS的目的，是真正能夠正確采購及合理實施的前提。任何軟件系統(tǒng)都不是萬能的，LIMS也同樣，真正的LIMS的意義在于規(guī)范檢測機構管理，提高管理水平。所以應該把LIMS看作是一個長期提高管理水平的工具，并不一定馬上看到工作量的減輕。
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實驗室的核心工作和核心職能是什么
每個檢測機構必有它的核心工作和核心職能，這也是LIMS最關心的，真正好的LIMS系統(tǒng)是關心核心工作和核心職能的系統(tǒng)。很多檢測機構在選擇LIMS時大都很看重參考計算機中心的意見，而大多數(shù)計算機中心人員往往看重系統(tǒng)和儀器的連接或是與硬件的匹配程度，甚至是開發(fā)技術或界面風格是否符合個人喜好的問題。往往導致LIMS選購舍本逐末。
因此，就目前LIMS市場狀況，在選擇時應考慮以下幾點：
縱觀當前LIMS市場，我們可以簡單地把LIMS系統(tǒng)劃分為三類：
第一類是小型LIMS系統(tǒng)，使用傳統(tǒng)開發(fā)工具，一般為單機版或C/S結構，其缺點是，無平臺升級成本高，功能相對簡單，穩(wěn)定性不強。
第二類是普通型LIMS系統(tǒng)，使用關系型數(shù)據(jù)庫，一般為C/S結構，包含了檢測流程、報告管理、資源管理及相應的安全設置，是國內(nèi)主流的LIMS產(chǎn)品，國內(nèi)外各主要LIMS供應商都提供此類型LIMS軟件，基本占到國內(nèi)LIMS軟件的80%以上的市場。
第三類是LIMS解決方案，基于應用服務器平臺和關系數(shù)據(jù)庫開發(fā)的應用系統(tǒng)，除了傳統(tǒng)意義上的LIMS以外，還包含，質(zhì)量追溯、客戶抱怨、質(zhì)控管理等與質(zhì)量管理相關的功能，并且如果客戶需要提供包括實驗室整體建設、管理培訓等軟性服務。
這類系統(tǒng)的優(yōu)點是和其他系統(tǒng)的接口相對容易，由于使用了關系數(shù)據(jù)庫系統(tǒng)，處理巨量數(shù)據(jù)時性能有大幅度提高，已經(jīng)對原有市場上的主要產(chǎn)品就會形成比較大的壓力。
選擇LIMS系統(tǒng)，不能僅僅著眼技術，需要考慮多方因素，還應該看公司實力、產(chǎn)品功能對需求的滿足程度、實施能力和價格等因素。
首先，明確自己的需求。如果沒有明確的需求，就會被產(chǎn)品供應商牽著鼻子走。很多時候，用戶在選擇軟件的時候，由于沒有清晰的需求，導致選型的過程變成了軟件測評博覽會。有了明確的需求，就可以根據(jù)自己需求、產(chǎn)品的功能，及二者的符合程度來選擇合適的產(chǎn)品。
其次，考察LIMS廠商的誠意和實力。沒有誠意的LIMS廠商，不會重視你。而僅有誠意是不夠的，如果LIMS廠商沒有相當?shù)馁Y金實力和技術實力，也無法最終有效解決問題。如果供應商中有檢測背景的專家就再好不過了。
第三，考察技術架構，靈活性和開放性不好的技術架構會讓企業(yè)付出代價。因為企業(yè)的內(nèi)部流程不會是一成不變的，因此LIMS系統(tǒng)也會經(jīng)常調(diào)整。如果LIMS系統(tǒng)的架構不好，降低了系統(tǒng)的柔性，就會在系統(tǒng)接口、可配置性、內(nèi)部集成性上留下隱患，導致系統(tǒng)封閉和僵硬，不能適應變化。特別是企業(yè)內(nèi)部都有一定量的信息系統(tǒng)在運行，LIMS系統(tǒng)和現(xiàn)有系統(tǒng)集成和兼容問題，也是LIMS選型中需要注意的一個因素。
第四，看項目團隊和實施方法。LIMS是一個企業(yè)應用軟件，實施過程不是簡單的軟件安裝，還有繁瑣的設置和大量的培訓工作。沒有好的實施項目團隊，會導致項目失敗。如果實施過程沒有保障的話，也是不能夠令人放心的.
最后，要選擇性價比合適的產(chǎn)品。
